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另外，藥師佛在經典中，也分成兩大系統，一支是藥師佛率領的日光菩薩、月光菩薩、藥樹王菩薩、如意珠菩薩和十二藥叉大將，八萬四千位藥叉。另一支則為「七佛藥師」，這七佛藥師，頗似「過去七佛」，只是過去七佛是在時間的差異，而七佛藥師，則是在「空間」上不同。據《藥師琉璃光七佛本願功德經》記載：「一東方此去四殑沙佛土，有世界名光勝，佛號善稱名吉祥王如來，曾發八大願。二東方去此五殑沙佛土，有世界名妙寶、有佛，其佛號為寶月智嚴光音自在王如來，曾發八大願。三東方去此六殑沙佛土，有世界名曰圓滿香積。有佛，

據《藥師經》記載，藥師佛說法時，會中有十二藥叉大將，名喚宮毗羅、伐折羅、迷企羅、安底羅、頞儞羅、珊底羅、因達羅、波夷羅、摩虎羅、真達羅、招杜羅、毗羯羅。

傳說藥師佛另外還有兩位特別助理，一是「如意珠王」、一位是「藥樹王」。根據《觀音玄義》所載，說藥樹王能透視人體〈相傳古代的神農氏，也具有此「特異功能」，而且其身體和藥樹王一樣，全身透明，五藏六腑，七經八脈，一目了然。其嚐百草後，即見其藥味走入身體內那個部位，藥性如何？清晰可見，如果中毒，其頭頂上長有一支角，手拉其角，用力旋轉，自然嘔吐，其毒立解。〉並且還為許多虔誠的信眾，在睡夢中醫治頑疾。而如意珠王則專為病人醫療有關於精神方面的疾病，祂手中有無數顆如意珠，據說，病人只要吞食一粒如意珠，其病立刻消除，精神就恢復正常。不但如此，藥師佛除了有藥樹王和如意珠王兩位權威的醫療師，尚有「十二藥叉大將」，各自統領七千部屬，在藥師佛名下，以神通力保護眾生。這支龐大的醫療團，相互之間，緊密連繫，機動力相當敏捷，個個法力高強，神通廣大。

《藥師經》中除了記載病患口誦其名號，以減輕痛苦及使病情穩定之外。尚有其他救助病人的方法。一、日夜勤誦《藥師咒》；誦此咒具有不可思議之功德，一切眾生病苦，皆得消除，或使病情逐漸穩定。二、如果有人一心要為他人除病去苦，首先要對病人經常施於盥洗、沐浴和漱口，讓他身體保持清淨，餵予食物或藥物及清淨的飲水前，對著食物、藥物及飲水，誠心持誦《藥師咒》一百零八遍，然後再給病人服用，其人一切病苦，隨之消除。

諸佛當中，藥師佛主掌東方淨琉璃國土、阿彌陀佛主管西方極樂世界、彌勒佛主掌兜率天彌勒淨土，釋迦牟尼佛主掌蓮花藏娑婆世界…祂們雖同為各世界教主，藥師佛的影響力卻無法和祂們相比，可是藥師佛打著為一切眾生除病苦、治頑疾的旗號，卻特別受到眾多病患和家屬的崇拜。生病的痛苦，垂死的掙扎哀號，那種充滿悲傷，無助和無奈的心情，唯有親身經歷，才能深深體會。藥師佛在眾生徬徨絕望之際，適時的伸出援手﹝雖然只是口號而已﹞不但在病患心中升起一線生機，也讓家屬充滿了感恩和敬重。

7.     願我來世得道時，若有女人，為百惡20所苦，願捨女身，念我名號，得轉女成男。甚至得成正果。

《藥師佛》

  　　　　　8、不思慧童子

　　　　　7、召請童子

６、救護慧童子

５、烏波計設尼童子

４、地慧童子

３、無垢光童子

２、計設尼童子

文殊師利菩薩八大童子

八制文殊配制八大童子，一光網童子。二地慧童子。三無垢光童子。四不思慧童子。五召請童子。六髻設尼童子。七救護慧童子。八鄔波髻設尼童子。

五字文殊：梵文Manjughosa，譯音為「曼殊伽娑」。即以「阿、羅、波、者、那」為真言之文殊師利菩薩。此尊頭上有五個頂髻，以表示五智。所以又稱為五髻文殊。

兩人拜完佛後，就走了出去，畏間想追上去問個究竟，兩人竟然像煙霧一般，散了開來，瞬間不見蹤影。想問帝釋天，轉過頭來，卻也不見祂的影子，站在面前的卻換成文殊菩薩。祂說：「爾識拜佛之女子否？」畏間點點頭。於是文殊又問：「其人是誰？」答曰：「上金光首！」文殊又問：「云何識得？」畏間便把日間之事說了一遍。文殊聽完畏間陳述之後，接著再問：「爾從今日事，悟出何道理？」

《大淨法門經》有段文殊菩薩度化弟子的故事。大意是說，古印度摩羯國有座觀園〈佛寺〉有一天，城中的長者之子畏間和一美女上金光首，來到園中獻花禮佛。這對俊男美女表面上是在拜佛，但是卻心不在焉，兩人眉來眼去，心猿意馬，根本無視上端的佛像，正在觀照著祂倆呢。

 據《大乘本生心地觀經》中，則稱文殊為「三世覺母妙吉祥」。與普賢同為釋迦牟尼佛之左右脇侍。關於這一點，許多佛教徒因此對於文殊之性別，提出質疑〈尤其在中國唐代之前對觀世音菩薩，都塑以男生相。後來唐太宗李世民即位，為了避諱，將觀世音的「世」字隱去，稱為「觀音」。從此觀音大士，在民間就成了位聞聲救苦、慈祥美麗的女菩薩〉，變男變女，變變變，觀音、文殊、普賢三大士之性別，一向爭論不休。但真正的身世和性別，在《現代封神榜‧天宮秘聞》一書中，業以揭曉。對此，元始大天尊波羅古元，這位宇宙的創始者，揭示了一句值得玩味的話，祂說：「對此問題爭執不休的人，應該罰抄《觀世音菩薩普門品》一萬卷。」降魔上王佛問曰：「何以如此？」釋迦牟尼佛正色道：「《妙法蓮華經》載說道：「世人應以比丘‧比丘尼‧優波塞‧優波夷‧長者‧居士‧宰官‧婆羅門婦女‧童男童女‧天龍‧夜叉‧乾闥婆‧阿修羅…等身得度者，則以其身為其說法。」降魔上王佛聞言，點頭讚歎道：「佛身本無相，其性無差別，為廣說佛法，顯應度迷津！」原始大天尊與釋迦牟尼佛，聞玄媚讚歎，微笑而退。