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 據《大乘本生心地觀經》中，則稱文殊為「三世覺母妙吉祥」。與普賢同為釋迦牟尼佛之左右脇侍。關於這一點，許多佛教徒因此對於文殊之性別，提出質疑〈尤其在中國唐代之前對觀世音菩薩，都塑以男生相。後來唐太宗李世民即位，為了避諱，將觀世音的「世」字隱去，稱為「觀音」。從此觀音大士，在民間就成了位聞聲救苦、慈祥美麗的女菩薩〉，變男變女，變變變，觀音、文殊、普賢三大士之性別，一向爭論不休。但真正的身世和性別，在《現代封神榜‧天宮秘聞》一書中，業以揭曉。對此，元始大天尊波羅古元，這位宇宙的創始者，揭示了一句值得玩味的話，祂說：「對此問題爭執不休的人，應該罰抄《觀世音菩薩普門品》一萬卷。」降魔上王佛問曰：「何以如此？」釋迦牟尼佛正色道：「《妙法蓮華經》載說道：「世人應以比丘‧比丘尼‧優波塞‧優波夷‧長者‧居士‧宰官‧婆羅門婦女‧童男童女‧天龍‧夜叉‧乾闥婆‧阿修羅…等身得度者，則以其身為其說法。」降魔上王佛聞言，點頭讚歎道：「佛身本無相，其性無差別，為廣說佛法，顯應度迷津！」原始大天尊與釋迦牟尼佛，聞玄媚讚歎，微笑而退。

釋迦牟尼佛在世傳教弘法期間，文殊始終隨侍在側，祂是釋尊得力的弟子，在各種弘法的盛會上，顯得特別活躍，就像一位精力充沛的童子。由於祂無怨無悔的付出，感化了許多權勢的子弟，走出生活圈，跟隨釋尊投入社會，走入群眾，同修菩薩道〈有如現代台灣的慈濟功德會，有錢出錢，有力的出力，大家同心協力，為社會盡一份力量〉，所以在許多大乘經典中，稱祂為「導師」。據說佛入滅前，曾交代文殊，佛入滅後，要祂和大迦葉、阿難、舍利佛等弟子，在鐵圍山結集28三藏教法。佛尊涅槃後，文殊帶領著眾佛門弟子五百人，依師尊托付，在鐵圍山結集大乘經典。使得大乘佛教得以傳於後世。